PLATAFORMA UNIVERSITARIA MULTIDISCIPLINARIA PARA EL APRENDIZAJE SOBRE LOS VIRUS: PUMAVIR

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Título :	PLATAFORMA UNIVERSITARIA MULTIDISCIPLINARIA PARA EL APRENDIZAJE SOBRE LOS VIRUS: PUMAVIR
Autor :	LAZCANO ARAUJO,ANTONIO EUSEBIO HERNANDEZ MORALES,RICARDO
Fecha de publicación :	2021
Resumen :	Se diseñará una plataforma digital de divulgación multidisciplinaria dirigida a las y los alumnos de Bachillerato de la Universidad Nacional Autónoma de México y de la Licenciatura en Biología de la Facultad de Ciencias. Dicha plataforma alojará distintos programas bioinformáticos, bases de datos de información biológica y social, investigaciones especializadas, conferencias impartidas por especialistas, material impreso en 3D, y material de divulgación para el apoyo en el aprendizaje del estudio de los virus desde una perspectiva biológica-evolutiva, médica y social. Se realizarán ciclos de conferencias con investigadores de distintas áreas que involucren a la virología, medicina, epidemiología y derechos humanos, mismas que estarán depositadas para su consulta en la plataforma. La plataforma estará acompañada de un instructivo digital con el cual las y los alumnos podrán adquirir conocimientos sólidos y previamente revisados, atendiendo a los contenidos procedimentales y actitudinales del proyecto. Este instructivo estará disponible para la comunidad de la Universidad Nacional Autónoma de México en la Red Universitaria de Aprendizaje, y los repositorios designados por este Programa de Apoyo. Asimismo, debido a la capacidad de acceder de manera remota a la plataforma, el alcance se podría extender a bachilleratos externos, así como a licenciaturas en Biología y Ciencias Sociales de otras universidades públicas del país y de América Latina. Las y los alumnos que se involucren en el proyecto tendrán una perspectiva multifactorial de la complejidad que involucra una pandemia.
URI :	https://www.innovacioneducativa.unam.mx:8443/jspui/handle/123456789/7795
metadata.dc.contributor.responsible:	LAZCANO ARAUJO,ANTONIO EUSEBIO
metadata.dcterms.callforproject:	2021
metadata.dc.coverage.temporal:	2021-2023
metadata.dcterms.educationLevel:	nivel superior
metadata.dcterms.educationLevel.SEP:	Licenciatura
metadata.dc.description.objective:	Objetivo general: Implementar una plataforma digital para depositar diversos materiales (programas, infografías, conferencias, galería virtual y física de estructuras de virus, secuencias genéticas de virus, simuladores de epidemias, investigaciones originales por parte de las y los alumnos y profesores sobre el SARS-CoV-2, y otras enfermedades virales desde una perspectiva biológica y social, abordando el problema de la pandemia de una manera multidisciplinaria, permitiendo que las y los alumnos de bachillerato y de licenciatura del área biológicas y de la salud tengan acceso a información actualizada acerca de la naturaleza biológica de los virus y el impacto social que fenómenos naturales tienen en una sociedad contemporánea. Se creará una vinculación académica entre la Escuela Nacional Preparatoria y la Facultad de Ciencias. Objetivos específicos: "1.-Construir una galería de estructuras terciarias virtual y física con la impresión de modelos 3D para acercar a los estudiantes al conocimiento de la organización y estructura tridimensional de los diferentes componentes virales como proteínas. Este material que es poco divulgado. 2.-Realizar un ciclo de conferencias con expertos en temas de biología, virología, epidemiología, derechos humanos, economía y sociología. 3.-Convocar a un encuentro académico denominado “Análisis de los efectos económicos y sociales del COVID-19 a la luz de los Derechos humanos”. Se pretende involucrar a la comunidad del bachillerato en la investigación y análisis de la problemática social. En dicho encuentro académico se realizarán conferencias magistrales de expertos, así como ponencias de profesoras y profesores, alumnas y alumnos. Profesores y alumnos realizarán exposiciones de investigaciones e infografías acerca de algún tema biológico o social relacionado con las pandemias o los virus. Dentro de este encuentro académico habrá un concurso en el que se reconocerá a las mejores exposiciones e infografías."
metadata.dc.description.strategies:	Con el presupuesto asignado, se comprará un servidor NAS con el suficiente poder de procesamiento y almacenaje para alojar y ejecutar los principales programas y algoritmos, además de las bases de datos revisadas por los responsables del proyecto, listas para utilizarse. En el servidor se descargarán las siguientes bases de datos de estructuras primarias y terciarias de proteínas, las cuales están disponibles en la red: Genbank, KEGG, Pfam, PDB. También se instalarán los siguientes programas para el estudio comparativo de las secuencias y estructuras terciarias, y se tendrán disponibles en descarga para la visualización y el análisis de las relaciones filogenéticas: BLAST (blastp, blastn, psiblast, deltablast), MUSCLE, PyMOL, Chimera, Dali, y programas para modelar estructuras en 3D como Autodesk-MAYA (molecular plug-in). Para la impresión de modelos en 3D los requisitos para solicitar una impresión serán: Ser miembro de la comunidad universitaria. Enviar su solicitud a través de la plataforma La plataforma recibe su solicitud que contendrán los siguientes puntos: Estructura PDB (código PDB) Justificación académica de la estructura a imprimir. Datos de identificación y contacto de los solicitantes Firma de carta compromiso con fines de justificación de gastos de materiales El responsable y corresponsable evalúan y dictaminan la viabilidad de la solicitud. Se les informa la decisión a los solicitantes que en caso de ser positiva Se les invita a los participantes a asistir al laboratorio de Origen de la Vida a modelar su molécula e imprimirla (si las condiciones sanitarias lo permiten). En caso de no poder asistir, se designa a algún miembro capacitado del laboratorio de Origen de la Vida en modelar e imprimir la molécula. Los archivos modelados estarán disponibles para su reimpresión en un catálogo descargable para todo público (.sdf). Se hace entrega de la molécula. Se hace seguimiento de la impresión. El contenido temático de la plataforma: Introducción a las bases de datos de secuencias moleculares Revisión general del contenido de la base de datos de secuencias e información molecular (NCBI) Revisión general del contenido de la base de datos de secuencias y procesos metabólicos (KEGG) Revisión general del contenido de la base de datos de dominios y estructuras terciarias de proteínas (Pfam y PDB) Obtención de secuencias y estructuras de proteínas de las bases de datos especializadas Obtención de secuencias en formato FASTA de las bases de datos KEGG y NCBI. Revisión de la información molecular de cada secuencia obtenida Obtención de archivos que contienen las coordenadas de los átomos de las estructuras terciarias de proteínas de la base de datos PDB Herramientas bioinformáticas para la búsqueda de homólogos Introducción a las herramientas Blast y Fasta Herramientas bioinformáticas para el alineamiento múltiple de secuencias Alineaciones múltiples utilizando el programa MUSCLE Herramientas bioinformáticas para la visualización y la edición de estructuras terciarias Manipulación de los archivos que contienen las coordenadas de las estructuras terciarias mediante la herramienta Pymol/Chimera Herramientas bioinformáticas para la comparación de estructuras terciarias Comparación pareada de estructuras terciarias con el programa Dali Comparación de estructuras terciarias con el programa Chimera Herramientas bioinformáticas para el establecimiento de relaciones evolutivas a partir de filogenias con estructura terciaria Construcción de árboles filogenéticos basados en distancia Herramientas bioinformáticas para la construcción de redes Obtención de secuencias de nucleótidos (KEGG\|NCBI) Comparación de secuencias de nucleótidos Cristalización de rayos X Obtención de estructuras terciarias (PDB) Generalidades de los virus Evolución de virus Modelaje de estructuras 3D Impresión de estructuras 3D Simuladores de epidemias ¿Cómo surgen las epidemias? ¿Cómo se comportan las epidemias? ¿Qué factores influyen en las epidemias? Derechos humanos durante las pandemias. Grupos vulnerables Violación a derechos humanos Movimientos sociales durante pandemias Violencia de género Organismos internacionales de Salud Otras enfermedades virales actuales y su impacto en la sociedad moderna VIH Papiloma Humano InfluenzaHepatitis C
metadata.dc.description.goals:	Primer año: Implementación de los servidores que alojarán los materiales del proyecto. Diseño y creación del instructivo y materiales originales para la RUA. Modelaje de estructuras 3D para imprimir. Impresión de estructuras virales 3D Publicación y difusión del instructivo de la plataforma digital en la Red Universitaria de Aprendizaje. Convocatoria al encuentro, ciclo de conferencias. Publicación del artículo del proyecto y del encuentro académico. Posible difusión virtual presencial en planteles de la ENP y Facultad de Ciencias (dependiendo de condiciones sanitarias) Segundo año: "Actualización de materiales y programación de un segundo ciclo de actividades. Creación de materiales originales por alumnos y profesores para la plataforma. Ciclo de conferencias con expertos en temas de virología, epidemiología, derechos humanos, derecho y sociología."
metadata.dc.description.selfAssessment:	Las actividades realizadas por el personal del Laboratorio de Origen de la Vida, y aquel que forma parte de la Escuela Nacional Preparatoria No. 8, en este proyecto DGAPA-PAPIME (PE204921), han sido satisfactorias a pesar de los enormes problemas y obstáculos que se presentaron durante la pandemia por COVID-19. Todos los integrantes nos sentimos complacidos de la labor realizada, se cumplió con el objetivo central que se enfoca en la enseñanza y aprendizaje para el beneficio de las y los alumnos, tanto del bachillerato como de la licenciatura, en temas relacionados con los virus vistos desde un enfoque evolutivo. Es importante mencionar que algunas actividades se vieron ligeramente modificadas por la situación de la pandemia; sin embargo, los objetivos centrales del proyecto se cumplieron satisfactoriamente. Adicionalmente, además de cumplir con las metas propuestas para este proyecto, durante el primer periodo, el grupo de Origen de la Vida impartió un total de 47 conferencias de divulgación y 17 conferencias y seminarios de investigación relacionados con los virus. Durante el segundo periodo, los integrantes del proyecto impartieron 23 conferencias de divulgación y 23 conferencias y seminarios de investigación relacionados con estos agentes virales.
metadata.dc.description.goalsAchieved:	Durante el tiempo que ha durado el proyecto DGAPA-PAPIME (PE204921) se ha cumplido con las metas propuestas. Por ejemplo, ya se tiene implementado el servidor que alberga todo el material que se ha desarrollado en este proyecto. También, ya se cuenta con el instructivo y los materiales de impresión de las estructuras tridimensionales de las proteínas virales que forman parte de los procesos de enseñanza y aprendizaje para la Red Universitaria de Aprendizaje (RUA). El instructivo anteriormente mencionado contiene la información para hacer uso de los repositorios de las estructuras terciarias de las proteínas virales, así como la información de los diversos programas que se utilizan para visualizar y analizar las estructuras proteínicas desde un enfoque evolutivo. La implementación del manual ha sido fundamental para llevar a cabo el Taller de Impresión de las Estructuras Tridimensionales de las Proteínas Virales, el cual permitió que el público interesado, tanto alumnos como profesores, pudiera hacer uso de la impresora 3D para generar materiales relacionados con diversas biomoléculas, por ejemplo, los ácidos nucleicos y las proteínas virales. Dicho taller formó parte del 2o. Encuentro Universitario sobre Virus - Plataforma Universitaria para el Aprendizaje de los Virus (PUMAVIR). El encuentro permitió que tanto estudiantes como los profesores presenciaran una serie de conferencias impartidas por especialistas en diferentes áreas relacionadas con la virología. Además, se fomentó la elaboración de infografías, carteles, trabajos de investigación y de divulgación, y creaciones artísticas, elaborados por los alumnos del bachillerato en diversos tópicos relacionados con estos agentes virales. Gracias al trabajo en conjunto del profesorado de la Escuela Nacional Preparatoria, plantel 8, y del Laboratorio de Origen de la Vida, se han podido realizar dos encuentros académicos que se han centrado en la enseñanza y aprendizaje que beneficie al estudiantado en temas relacionados con los virus vistos desde un enfoque evolutivo. El segundo encuentro se llevó a cabo del 7 al 9 de diciembre del 2022, y fue una consecuencia directa del éxito y beneficios que se tuvieron del 1er Encuentro PUMAVIR que se realizó del 8 al 11 de noviembre del 2021. En ambos encuentros, los integrantes que forman parte del proyecto que incluyen al Dr. Antonio Lazcano, el Dr. Ricardo Hernández, el Dr. Arturo Becerra, el Dr. Rodrigo Jácome, el Dr. José Campillo, el M. en C. Wolfgang Cottom, y a la estudiante Hilda Palacios, tuvieron una participación muy activa en la planeación y desarrollo de actividades. Los trabajos de investigación que fueron apoyados por el proyecto PAPIME en el primer año dieron como resultado dos publicaciones en revistas indizadas, mientras que en el segundo año se publicaron cuatro trabajos de investigación y dos capítulos de libro.
metadata.dcterms.provenance:	Facultad de Ciencias
metadata.dc.subject.DGAPA:	Biología
metadata.dc.type:	Proyecto PAPIME
metadata.dc.contributor.coresponsible:	HERNANDEZ MORALES,RICARDO
Aparece en las colecciones:	2. Área de las Ciencias Biológicas, Químicas y de la Salud

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