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Título : PCR PARA LA TIPIFICACIÓN DE MUESTRAS CLÍNICAS DE LOS ANIMALES DOMÉSTICOS
Autor : MIRANDA MORALES, ROSA ELENA
SARMIENTO SILVA,ROSA ELENA
Fecha de publicación : 2017
Resumen : El desarrollo de este proyecto es con el fin de que la materia Temas selectos de profundización disciplinaria Bacteriología diagnóstica adquiera un conocimiento integral de las diferentes ramas del diagnóstico microbiano con las técnicas estándar de la microbiología convencional y la aplicación de herramientas moleculares como la PCR. Con el fin de que el estudiante conozca técnicas actuales que le permitan realizar su ejercicio profesional de mejor calidad y darle la seguridad en su quehacer diario. Para ello se realizaran tres prácticas de muestras, leche, orina e hisopo nasal, de enfermedades bacterianas más frecuentes en los animales domésticos, así como tres videos y un manual técnico digital. Las prácticas se impartirán en el laboratorio de Bacteriología y micología en la materia de temas selectos de profundización disciplinaria Diagnóstico bacteriológico de los animales domésticos. La materia se imparte en 60 horas, 6 horas diarias. Esta materia se abrió a partir de un proyecto PAPIME PE 205107, en el que se propuso el diseño de las prácticas y como producto un manual. El programa de la materia tiene 11 prácticas y 6 anexos, todas ellas diseñadas para que el alumno obtenga el conocimiento y desarrollar actitudes y aptitudes en el diagnóstico bacteriológico convencional, en el que aprenden a sembrar en diferentes medios de cultivo muestras clínicas, aislar e identificar bacterias con pruebas bioquímicas. Esta materia es apoyada por varios académicos expertos en el diagnóstico veterinario y desde el 2010 se imparte, a la fecha se han preparado más de 100 alumnos y cada día tiene más solicitudes por los alumnos para cursarla. Actualmente, es importante acceder a las nuevas técnicas de diagnóstico bacteriano como las técnicas moleculares que nos dan certeza para la identificación bacteriana. Es por ello, que se eligieron tres prácticas Análisis bacteriológico de leche, análisis bacteriológico de orina y análisis bacteriológico de excreciones para que el alumno aplique la PCR en las muestras clínicas y obtenga el conocimiento teórico-práctico de la extracción, purificación del ADN y la identificación del agente etiológico utilizando los cebadores necesarios para cada especie bacteriana involucrada. El alumno realizara en cada una de esas muestras seleccionadas el análisis bacteriológico convencional y la PCR, para que comprenda de la sencillez y complejidad de cada procedimiento, y obtendrá las habilidades y destrezas en el laboratorio de diagnóstico para establecer la etiología bacteriana de una muestra clínica. El alumno trabajará con muestras de leche, orina y excreciones que provienen de procesos infecciosos, para el caso de la leche debe conocer que la mastitis bovina es la inflamación de la glándula mamaria que puede ser causada por varias especies de bacterias. Se ha demostrado que la mayoría de las mastitis clínica y subclínica es causada por 10 especies bacterianas diferentes. Los patógenos asociados a la mastitis están clasificados como patógenos contagiosos y medio ambientales. Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, y Streptococcus dysgalactiae son patógenos contagiosos y pueden propagarse de vaca a vaca durante el ordeño. En la muestra de orina debe de conocer que el tracto urinario es estéril, situación dada por una variedad de mecanismos del huésped para prevenir la colonización y sobrevivencia de las bacterias. Las bacterias que causan infecciones urinarias generalmente son bacterias oportunistas de la microbiota intestinal que entra a la vejiga a través de la uretra. Las infecciones dependen de los factores anatómicos, mecanismos de defensa del huésped y de la patogenicidad del agente. Para los exudados, debe conocer que las infecciones del tracto respiratorio puede obtener hisopos nasales de las secreciones. La neumonía en los bovinos es una de las principales causas de pérdidas económicas debido a la alta mortalidad, costos en los tratamientos, mala conversión alimenticia, disminución en la ganancia de peso, falta de desarrollo corporal en la edad adulta y disminución en la producción de los hatos afectados. La etiología de estas neumonías puede ser multifactorial, dentro de las cuales se han involucrado agentes bacterianos y virales. Entre los agentes bacterianos mayormente aislados se mencionan a: Pasteurella multocida, Mannheimia haemolytica, Histophilus somni, Mycoplasma, Streptococcus spp. La importancia de establecer las especies de Mannheimia requiere de nuevos criterios de identificación que incluye las técnicas moleculares como procedimientos más sensibles. La eficiente prevención y control de la mannheimiosis bovina debe ser sustentada por un diagnóstico confiable y con buenas prácticas de manejo.
URI : http://132.248.161.133:8080/jspui/handle/123456789/7176
metadata.dc.contributor.responsible: MIRANDA MORALES, ROSA ELENA
metadata.dc.coverage.temporal: 2017-2019
metadata.dc.description.objective: OBJETIVO GENERAL Crear los escenarios teóricos - prácticos para que los estudiantes que cursan la carrera de Médico Veterinario zootecnista obtengan los conocimientos de la bacteriología diagnóstica molecular, utilizando la técnica de la PCR, para desarrollar aptitudes, actitudes en el diagnostico bacteriológico. OBJETIVOS PARTÍCULARES. 1.Diseñar tres prácticas para la compresión teórico-práctica que contendrá, objetivos, introducción, materiales y procedimientos para el diagnóstico molecular con la PCR. 2.Estandarizar la prueba de la PCR punto final para identificar a Pasteurella multocida; serotipo A y D, y a Mannheimia haemolytica a partir de muestras clínicas de hisopos nasales de bovinos 3.Estandarizar la prueba de la PCR punto final para identificar a Staphylococcus aureus y a Streptococcus agalactiae a partir de muestras clínicas de leche de bovino 4.Estandarizar la prueba de la PCR punto final para identificar a Escherichia coli a partir de muestras de orina de perro. 5.Elaborar material audio visual para la capacitación en la prueba diagnóstica molecular PCR para los agentes bacterianos involucrados en las infecciones de los animales domésticos para el conocimiento teórico-práctico de los estudiantes de licenciatura de medicina veterinaria. 6.Elaborar un manual técnico digital del procedimiento de diagnóstico molecular con la PCR punto final de muestras de animales clínicas con infecciones bacterianas.
metadata.dc.description.hypothesis: Este proyecto pretende que el alumno tenga un conocimiento integral de las diferentes ramas del diagnóstico microbiano con las técnicas estándar de la microbiología convencional y la aplicación de herramientas moleculares como la PCR. Con el fin de que el estudiante conozca técnicas actuales que le permitan realizar su ejercicio profesional de mejor calidad y darle la seguridad en su quehacer diario para la eficiencia clínica. Para ello, se realizaran tres prácticas de muestras, leche, orina e hisopo nasal, de enfermedades bacterianas más frecuentes en la población animal. Prácticas que se impartirán en el laboratorio de Bacteriología y Micología en la materia de temas selectos de profundización disciplinaria Diagnóstico bacteriológico de los animales domésticos. Materia que se imparte a partir del octavo semestre en el plan de estudios vigente de la carrera de Médico Veterinario Zootecnista. Entre los productos finales del proyecto se encuentran tres videos y un manual técnico digital los cuales permitirán al alumno una mejor comprensión e interpretación de estas técnicas moleculares y su aplicación en el diagnóstico bacteriano.
metadata.dc.description.strategies: Actualmente, por la aplicación de antimicrobianos, como medidas de control, es difícil detectar la presencia de los microorganismos viables con las técnicas convencionales de aislamiento e identificación bioquímica, por lo que es importante optar por nuevas herramientas que nos den la certeza del diagnóstico bacteriano. Las pruebas moleculares son esa herramienta, como la PCR que permiten diagnosticar la presencia de estos agentes con resultados confiables, en menor tiempo, aunque el microorganismo no se encuentre viable en la muestra. Para la aplicación de esta prueba es necesario conocer las diferentes bacterias involucradas y/o grupos en las infecciones de los animales, así como los mecanismos de patogenicidad del microorganismo para realizar una prueba confiable seleccionando la secuencia determinante para la selección de los iniciadores específicos y así establecer el diagnóstico molecular del agente etiológico. Para dar cumplimiento al objetivo general: Crear escenarios teóricos-prácticos en los estudiantes que cursan la materia temas selectos de profundización disciplinaria Bacteriología diagnóstica de los animales domésticos de la carrera de Medicina Veterinaria y Zootecnia con el fin de que obtengan el conocimiento de las herramientas moleculares para el diagnóstico bacteriano. Para ello se plantearon los objetivos particulares: resaltar la importancia de las herramientas moleculares en el proceso de formación cognitiva de los estudiantes de la carrera de Medicina Veterinaria y Zootecnia de la UNAM y que obtengan el conocimiento en la materia de Temas selectos de Bacteriología diagnóstica del Departamento de Microbiología e Inmunología. Para el primer objetivo se diseñarán tres prácticas para el diagnóstico molecular con la PCR en muestras de leche, orina e hisopos nasales. En el contenido de cada práctica se plantearan, objetivos, introducción, materiales y procedimientos para el diagnóstico molecular con la PCR. Para el segundo objetivo se estandarizaran la PCR punto final para identificar a Pasteurella multocida; serotipo A y D, y a Mannheimia haemolytica a partir de muestras clínicas de hisopos nasales de bovinos, así como la PCR punto final para identificar a Staphylococcus aureus y a Streptococcus agalactiae a partir de muestras clínicas de leche de bovino y la PCR punto final para identificar a Escherichia coli a partir de muestras de orina de perro. La estandarización se realizará con cepas de referencia ATCC para los controles positivos, se realizará la selección de cebadores según las particularidades de cada microorganismo a identificar. Para la estandarización de las diferentes PCR, la extracción de ADN se realizará usando Kits comerciales (Columnas de afinidad Qiagen), a partir de cepas tipo, propagadas in vitro, se analizará la pureza del mismo y se cuantificará, una vez hecha la reacción de PCR, los productos de amplificación se visualizarán en geles de agarosa y se purificarán mediante columnas de afinidad. Una vez estandarizadas las diferentes reacciones de PCR se procederá a analizar muestras biológicas, previamente inoculadas con cada cepa (esto con la finalidad de que los estudiantes puedan hacer la identificación molecular). El tercer objetivo es la elaboración de material audio visual para la capacitación en el diagnóstico bacteriano molecular, con la PCR, con el fin de que los estudiantes de licenciatura de medicina veterinaria tengan acceso a material didáctico y puedan reforzar el conocimiento teórico-práctico, y el cuarto objetivo es elaborar un manual técnico digital del procedimiento de diagnóstico molecular mediante PCR punto final de muestras clínicas de animales con infecciones bacterianas. Con estos objetivos se plantea una metodología de enseñanza aprendizaje a través de las prácticas teóricopráctico, con el apoyo de los videos y el manual práctico digital se desarrollará actitudes, aptitudes en el estudiante que se prepara en el diagnóstico microbiano.
metadata.dc.description.goals: PRIMER AÑO. SE DISEÑARAN TRES PRÁCTICAS DE LABORATORIO. 1.- DISEÑO DE LA PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA MUESTRAS DE LECHE DE BOVINO. 2.- DISEÑO DE LA PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA MUESTRAS DE HISOPO NASAL DE BOVINO 3.- DISEÑO DE LA PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA MUESTRAS DE ORINA DE PERRO SEGUNDO AÑO. 1.- SE DISEÑARAN LOS INICIADORES Y SE ENVIARAN A SINTETIZAR EN LABORATORIOS ESPECIALIZADOS 2.- PRODUCCIÓN Y EDICIÓN DE TRES VIDEOS: A). PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA EL DIAGNÓSTICO BACTERIANO EN MUESTRAS DE LECHE DE BOVINO B). PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA EL DIAGNÓSTICO BACTERIANO EN MUESTRAS DE HISOPO NASAL DE BOVINO C). PRÁCTICA DE LABORATORIO DE LA TÉCNICA DE PCR PARA EL DIAGNÓSTICO BACTERIANO EN MUESTRAS DE ORINA DE PERRO TERCER AÑO. 1.- ELABORACIÓN, PRODUCCIÓN Y EDICIÓN DE UN MANUAL TÉCNICO DIGITAL TITULADO: DIAGNÓSTICO MOLECULAR CON LA TÉCNICA DE PCR PARA MUESTRAS DE LECHE, ORINA E HISOPO NASAL DE ANIMALES DOMÉSTICOS.
metadata.dc.description.selfAssessment: El apoyo del PAPIME permitió que se cumplieran al 100% los objetivos, metas y productos propuestos en este proyecto. Se lograron diseñar los iniciadores para nueve microorganismos asociados a problemas infecciosos en los animales domésticos, en los procesos patológicos como la mastitis, cistitis y problemas respiratorios. El estandarizar la PCR para cada microorganismo, permitió aplicar esta herramienta en el laboratorio de prácticas para la materia de Temas Selectos de Bacteriología Diagnóstica de los animales domésticos. Es así, que los alumnos tuvieron la oportunidad de realizar la PCR punto final de muestras directas y comprender estas nuevas opciones del diagnóstico microbiológico molecular, temas que no se encuentran presentes en el plan de estudios actual. Los alumnos tuvieron la oportunidad de comparar y diferenciar entre realizar el diagnóstico convencional que es es el identificar con reacciones metabólicas a la bacteria aislada de una muestra clínica y el de realizar la técnica molecular que identifica regiones específicas para un microorganismo. Con esta práctica, se alcanzó incentivar en el alumno la enseñanza- aprendizaje para la comprensión del tema, así como adquirir habilidades y destrezas en la realización de esta herramienta molecular importante en el ámbito de la salud actual. Se logró que los alumnos de los semestres 8°, 9° y 10° comprendieran los beneficios de esta técnica molecular para obtener un diagnóstico confiable de alta especificidad, así como lograr su interpretación y aplicación que puede beneficiar en su desarrollo y práctica profesional. Se diseñaron tres prácticas para el diagnóstico bacteriano por la técnica de la PCR en muestras clínicas de leche, orina e hisopo nasal de los animales domésticos, éstas prácticas servirán de apoyo a los alumnos cuando realicen la técnica molecular en el laboratorio. Cada una de las prácticas contiene Título, objetivo particular, introducción, equipo, materiales, reactivos y biológicos, procedimiento, resultados que debe alcanzar en la práctica, hoja de trabajo, hoja de evaluación y bibliográfica. Las cuales fueron integradas en el Manual digital "PCR para la tipificación bacteriana de muestras clínicas de los animales domésticos", junto con 4 anexos que explican los procesos para realizar la PCR. Se realizaron y editaron tres videos que contienen los procedimientos para realizar la técnica de la PCR en muestras clínicas de leche, orina e hisopo nasal. Estos videos servirán de apoyo a los alumnos para la comprensión de esta técnica molecular de forma didáctica, fortalecer la enseñanza-aprendizaje y lograr que el alumno obtenga habilidades y destrezas en el laboratorio de prácticas. El presupuesto asignado fue ejercido en el 100% .
metadata.dc.description.goalsAchieved: Las metas correspondientes al primer año se lograron al 100 % . Se diseñaron las tres prácticas de laboratorio propuestas. Práctica 1. Identificación molecular de patógenos bacterianos en una muestra de leche de bovino Práctica 2. Identificación molecular de patógenos bacterianos en una muestra de orina de perro Práctica 3 Identificación molecular de patógenos bacterianos en una muestra de hisopo nasal de bovino Cada práctica contiene: Título Objetivo Introducción Equipo, materiales, reactivos y biológicos Procedimiento Resultados que el alumno debe obtener en la práctica Hoja de trabajo que el alumno llenará en su práctica Hoja de evaluación Bibliografía Estas tres prácticas forman parte del Manual Digital "PCR para la tipificación bacteriana de muestras clínicas de los animales domésticos. En el manual se incluyen además cuatro anexos que propone explicar los procedimientos para la realización de la PCR. Anexo 1. Extracción de ADN Anexo 2, Cuantificación e integridad del ADN Anexo 3. Reacción de la PCR Anexo 4. Electroforesis con la obtención de los productos amplificados de la PCR Las metas correspondientes para el segundo año se cumplieron en el 100% 1. Diseñar iniciadores Se diseñaron los iniciadores para las bacterias Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis y Streptococcus dysgalactiae para identificar a estos microorganismos con la PCR de muestras de leche de bovino. Se diseñaron los iniciadores para las bacterias Pasteurella multocida Tipo A, Pasteurella multocida tipo D y Manheimia haemolytica para identificarlas con la PCR en muestras de hisopo nasal de bovino. Se diseñaron los iniciadores para E coli para los patotipos: E. coli enteroagregativa y E. coli uropatógena para identificarlos en una muestra de orina de perro con la PCR. 2. Producción y edición de tres videos Se realizó la producción y edición de tres videos para la comprensión didáctica de la técnica de la PCR para el diagnóstico de bacterias patógenas en las muestras de leche de bovino, orina de perro e hisopo nasal de bovino. Cada video incluyen los procesos de: Extracción de ADN Cuantificación del ADN Reacción de la PCR Electroforesis con la obtención de los productos amplificados de la PCR Estos videos servirán de apoyo didáctico para las prácticas diseñadas para cada una de las muestras, con el fin de que el alumno integre el conocimiento y apoye en su enseñanza-aprendizaje. .
metadata.dcterms.provenance: Fac. Medicina Veterinaria y Zootecnia
metadata.dc.subject.DGAPA: Zootecnia, veterinaria y acuacultura
metadata.dc.type: Proyecto PAPIME
metadata.dc.contributor.coresponsible: SARMIENTO SILVA,ROSA ELENA
Aparece en las colecciones: 2. Área de las Ciencias Biológicas, Químicas y de la Salud

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