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Título : Manual de Prácticas para Simulación Molecular de Materiales y Biomoléculas
Autor : DOMINGUEZ DUEÑAS, LAURA
AMADOR BEDOLLA,CARLOS
Fecha de publicación : 2018
Resumen : El avance computacional de los últimos decenios ha permitido el desarrollo de un área de análisis químico fundamental adicional: la simulación molecular. En efecto la investigación química dispone actualmente del uso de simulación molecular para complementar la información que encuentra y justifica sus resultados. Dos técnicas físicas fundamentales son requeridas: la mecánica clásica y la mecánica cuántica. Estas técnicas más frecuentemente se combinan. En las licenciaturas de la facultad de química, estas técnicas se enseñan a niveles avanzados principalmente en las materias de Introducción a la Simulación Molecular y Química Cuántica II. Los estudiantes que cursan estas materias optativas han estudiado sus fundamentos y han mostrado interés en profundizar en dichos temas. Si bien el estudio de los fundamentos es posible sin el dominio de las técnicas y detalles del cómputo de alto rendimiento la profundización los requiere. Adicionalmente, sin bien los recursos didácticos (libros de texto y páginas de internet) para el estudio de los fundamentos existen, su contraparte para la aplicación práctica es mucho más escaso. En este proyecto proponemos la creación de un manual de prácticas y una página de internet que tienen como objetivo llenar esta ausencia de material.
URI : http://132.248.161.133:8080/jspui/handle/123456789/7054
metadata.dc.contributor.responsible: DOMINGUEZ DUEÑAS, LAURA
metadata.dc.coverage.temporal: 2018-2019
metadata.dc.description.objective: Desarrollar material didáctico y complementario para las asignaturas de Introducción a la Simulaición Molecular y Química Cuántica II en la forma de un manual de prácticas y de una página de internet cuyo contenido abarque desde las bases de programación hasta el uso de herramientas y programas complejos de la mecánica molecular y de la mecánica cuántica.
metadata.dc.description.hypothesis: El material desarrollado por este proyecto será de gran utilidad para los estudiantes interesados en la simulación molécular como herramienta para la predicción de propiedades químicas de materiales, fármacos y procesos bioquímicos. El material desarrollado coadyuvará a incrementar el interés de los estudiantes de las licenciaturas de la facultad de química en estas modernas técnicas de análisis químico.
metadata.dc.description.strategies: Se desarrollarán 13 prácticas de laboratorio de cómputo para cada materia mediante las cuales los alumnos progresarán en su capacidad de escribir programas de cómputo. Los lenguajes de cómputo moderno permiten obtener resultados de alto nivel con una curva de aprendizaje mínima. Seleccionamos los lenguajes de programación Shell y Python por la combinación de sus capacidades y su amplia disponibilidad en las computadoras de todos de nuestros alumnos. En la página de internet se presentarán programas didácticos (en versiones profesionales) realizados por los responsables del proyecto en colaboración con becarios y estudiantes que han destacado en la adquisición de esas habilidades.
metadata.dc.description.goals: Todos los entregables que se ofrecen en este proyecto serán producidos y puestos a disposición de los estudiantes en el primer año; durante su producción en los cursos que se imparten continuamente y como productos finales al terminar el periodo del proyecto. Posteriormente a la culminación exitosa de este proyecto, los responsables contemplan la posibilidad de condensar el material en la creación de un libro de texto.
metadata.dc.description.selfAssessment: El proyecto va muy bien, generamos material de muy buena calidad que sin duda ha sido bien recibido por los estudiantes de licenciatura. Sin embargo no hemos concluido con la totalidad del material planteado originalmente.
metadata.dc.description.goalsAchieved: 1. Durante el desarrollo de este proyecto de enseñanza y docencia, se concluyó la elaboración de seis prácticas y seis programas de cómputo. Tenemos planeado hacer 12 sin embargo, aunque tenemos ya gran parte del material, no las hemos concluido. • Linux (versiones para Windows), Editores (VI) Y Python • Oscilador armónico • Newton Raphson • Modos Normales • Funciones de Distribución • Método Variacional • Gas de malla e inmiscibilidad • Simulación de gases • Sistema de ecuaciones • Benceno Huckel • Sistema solar clásico • Modelo de Ising MonteCarlo 2. Las prácticas y programas de cómputo elaborados durante el desarrollo de este proyecto de educación se utilizaron durante los cursos impartidos en los semestres 2019-1 y 2018-2 con muy buena recepción por parte de los estudiantes. 3. El desarrollo de la página de internet que albergará los programas de cómputo y la primera versión del manual electrónico de nuestras prácticas tampoco ha sido terminada debido a que no hemos concluido la elaboración de todo el material. Sin embargo, se pagó ya a un proveedor de páginas de internet, únicamente falta concluir la totalidad del material. 4. Se becó a los estudiantes Alejandra del Río Lima y Víctor Calvo por su participación en la elaboración del material generado, ayudaron en la elaboración de las prácticas y los programas de cómputo. Durante el desarrollo de este proyecto, también colaboró el estudiante Humberto Tadeo Flores Trujillo. 5. Se adquirieron dos equipos de cómputo que fueron utilizados para impartir las clases y enseñar programación a los estudiantes de licenciatura de los cursos de Simulación Molecular y Química Cuántica II, materias de la licenciatura en química de la facultad de química de la UNAM
metadata.dcterms.provenance: Fac. Química
metadata.dc.subject.DGAPA: Química
metadata.dc.type: Proyecto PAPIME
metadata.dc.contributor.coresponsible: AMADOR BEDOLLA,CARLOS
Aparece en las colecciones: 2. Área de las Ciencias Biológicas, Químicas y de la Salud

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