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Título : Seminario Interinstitucional de Biología Matemática y Computacional
Autor : PLAZA VILLEGAS, RAMON GABRIEL
VELASCO HERNANDEZ, JORGE XICOTENCATL
Fecha de publicación : 2016
Resumen : El objetivo principal de este proyecto es la constitución de un seminario interinstitucional sobre la síntesis de biología y las ciencias matemáticas y computacionales, dirigido a estudiantes de licenciatura, maestría, y doctorado, investigadores, profesores y post-doctorandos interesados. Se espera que este seminario sirva de catalizador para la constitución de una red temática dentro de la UNAM que tenga como objetivo compartir intereses de docencia y de difusión en torno a las ciencias biológicas y sus interacciones con las ciencias matemáticas, así como promover métodos teóricos y computacionales en la comunidad que trabaja en ciencias biológicas y de la salud. Asimismo, a partir de la constitución de este Seminario, se espera la integración de investigadores de ciencias biológicas y ciencias matemáticas en actividades académicas comunes que pudieran llevar a colaboraciones multidisciplinarias y multi-institucionales. Se pretende que el seminario y las actividades en torno al mismo incidan de manera positiva en las tareas docentes y de investigación de la comunidad académica interesada en Biología Matemática y Computacional. A continuación, se presenta una propuesta unificada en torno a la síntesis entre las Ciencias Biológicas y las Ciencias Matemáticas y Computacionales, con el fin de estimular la investigación y la formación de jóvenes.
URI : http://132.248.161.133:8080/jspui/handle/123456789/5990
metadata.dc.contributor.responsible: PLAZA VILLEGAS, RAMON GABRIEL
metadata.dc.coverage.temporal: 2016-2018
metadata.dcterms.educationLevel.SEP: Licenciatura
metadata.dc.description.hypothesis: Se pretende proyectar al Seminario Interinstitucional de Biología Matemática y Computacional como actividad integradora de las capacidades académicas, de recursos humanos y vinculación en las áreas temáticas del mismo, en las diversas unidades académicas de nuestra Universidad.
metadata.dc.description.strategies: 1. Organización del Seminario con planeación annual, por 9 meses de cada año. 2. Mesas redondas, talleres y minicursos satélites asociados al Seminario. 3. El Seminario cubrirá áreas temáticas de aplicación presentes en nuestra universidad y otras como propuestas de exploración. En particular se tratarán temas de ecología, genómica, genómica computacional, biotecnología, epidemiología, morfogénesis, crecimiento de cánceres e inmunología; en lo que respecta a herramientas se comprenderán temas de ecuaciones diferenciales ordinarias y parciales, análisis numérico, uso de herramientas de cómputo paralelo de alto rendimiento, optimización, teoría de juegos, cuantificación de incertidumbre, bioinformática, procesos estocásticos y probabilidad, teoría de gráficas y bioestadística, entre otras. 4. Los investigadores serán tanto nacionales como extranjeros incluyendo investigadores senior, líderes en sus líneas de trabajo, así como investigadores junior en las etapas iniciales de su carrera. Se buscará un balance adecuado de género.
Objetivo principal: La constitución de un seminario interinstitucional sobre la síntesis de biología y las ciencias matemáticas y computacionales, dirigido a estudiantes de licenciatura, maestría, y doctorado, investigadores, profesores y post-doctorandos interesados. Logros esperados: Promoción de métodos teóricos y computacionales en la comunidad que trabaja en ciencias biológicas y de la salud. Catalizador para la constitución de red temática dentro de la UNAM que tenga como objetivo compartir intereses de docencia, difusión en investigación en torno a las ciencias biológicas y sus interacciones con las ciencias matemáticas. Integración de investigadores de ciencias biológicas y ciencias matemáticas en actividades académicas comunes para generar colaboraciones multidisciplinarias y multiinstitucionales. Formación de recursos humanos, reclutamiento de estudiantes de posgrado. Organización de cursos impartidos por especialistas invitados (nacionales y extranjeros) dirigidos a estudiantes e investigadores en temas específicos.
metadata.dc.description.goals: Metas principales: 1. Se organizaron 6 conferencias de biología matemática y computacional. La lista de expositores es la siguiente: Dr. Víctor Breña (Centro de Ciencias Matemáticas, UNAM) - 2 veces Dr. Corrado Mascia (Universidad de Roma La Sapienza) Dra. Chiara Simeoni (Universidad de Niza, Sophia-Antipolis) Dr. Guillermo Ramírez (Instituto de Matemáticas, UNAM, Campus Juriquilla) Dr. Hartmut Schwetlick (Universidad de Bath, Inglaterra) 2. Se organizó el "1er. Taller Internacional de Métodos Matemáticos y Numéricos en Dinámica Espacio-Temporal". La principal motivación fue ofrecer a estudiantes avanzados de licenciatura y a estudiantes de posgrado en áreas como biología teórica, biofísica, biología matemática y computacional, así como a investigadores interesados, un taller que reuniera, de manera sistemática y unificada, una visión teórica y numérica de modelos en ecuaciones en derivadas parciales que se emplean para describir fenómenos de dinámica espacio-temporal con aplicaciones específicas a Biología. El taller consistió en dos mini-cursos y conferencias plenarias de investigación. Se inscribieron 19 estudiantes: 2 del posgrado en ciencias biomédicas; 3 del posgrado conjunto en matemáticas entre la UMSNH y la UNAM en Morelia; 3 alumnos de maestría en matemátias de la UAM; 1 estudiante de física del IPN; 2 alumnos de licienciatura en física de la UNAM; y 8 estudiantes de maestría y doctorado del posgrado en ciencias matemáticas de la UNAM. Con los recursos del proyecto se pudieron solventar los gastos (viáticos y transporte) de los conferencistas y de los instructiores de los cursos, así como a los estudiantes que nos visitaron de fuera de la Ciudad de México. El mayor logro del taller fue reunir a estudiantes de posgrado de distintas áreas y sedes, alrededor de una temática y metodología comunes. La interacción transdisciplinaria entre todos los participantes, así como la elección temática de estudio (que combinó elementos prácticos y teóricos unificadamente), fueron las principales aportaciones de este taller. Esperamos que esta interacción continúe en futuras ediciones. 3. Tesis doctoral de Juan Francisco Leyva Bonilla Otro producto asociado al proyecto es la tesis doctoral del M. En C.Juan Francisco Leyva Bonilla, en el área de modelación, análisis matemático y simulación numérica de sistemas de ecuaciones en derivadas parciales aplicadas a sistemas químico-biológicos. El proyecto PAPIME apoyó en la última etapa de la tesis doctoral de Juan Francisco, el cual es reconocido en la impresión final de la tesis. La tesis de Juan Francisco versa sobre modelos de difusión no lineal cruzada y quimiotaxis para colonias de bacterias. 4. Artículos de investigación derivados de interacciones con estudiantes de posgrado. Otro logro del proyecto fue la culminación de trabajos de investigación con alumnos de maestría y doctorado. Se publicó un artículo de investigación durante el 2017 y otros dos han sido enviados para su publicación.
metadata.dc.description.selfAssessment: Los responsables del proyecto consideramos que el apoyo del PAPIME fue fundamental en el desarrollo de las siguientes actividades: (a) El establecimiento de una red temática dentro de la UNAM para compartir intereses de docencia y de difusión en torno a las ciencias biológicas y sus interacciones con las ciencias matemáticas, así como para promover métodos teóricos y computacionales en la comunidad que trabaja en ciencias biológicas y de la salud. Asimismo, se fomentó la integración de investigadores de ciencias biológicas y ciencias matemáticas en actividades académicas comunes que pudieran llevar a colaboraciones multidisciplinarias y multi-institucionales. (b) El proyecto fue exitoso en su conexión con estudiantes, en particular, con estudiantes de los distintos posgrados involucrados en este tema, como son el Posgrado en Ciencias Matemáticas y el Posgrado en Ciencias Biomédicas, entre otros. Se logró establecer un vínculo académico entre los estudiantes de distintos posgrados, así como entre los investigadores y los estudiantes. Los seminarios y talleres estuvieron repletos, y la audiencia tuvo una respuesta muy positiva. Asimismo, se establecieron contactos entre estudiantes de posgrado de la UNAM e investigadores extranjeros expertos en el área. (c) El proyecto PAPIME también fue pivotal para que trabajos de investigación con estudiantes de Posgrado fuesen terminados y enviados para posible publicación. Los estudiantes José Alejandro Butanda (maestría) y Juan Francisco Leyva Bonilla (doctorado) terminaron sus respectivas tesis con el apoyo del proyecto. También se publicó un artículo de investigación y se sometió un segundo para posible publicación en reconocidas revistas sobre el tema, ambos con reconocimiento al proyecto PAPIME. (d) Finalmente, el proyecto se diseñó para apoyar la edición de dos libros, uno escrito por el Dr. Jorge Velasco, y un segundo en co-autoría con el Dr. Ramón Plaza. A pesar de los esfuerzos, ambos libros están todavía en proceso de escritura y a la fecha (20 de marzo del 2018), se cuenta únicamente con un 50% de avance. El proyecto PAPIME ha sido fundamental en la elaboración de ambos libros y se dará reconocimiento a la DGAPA en ambos una vez que los productos hayan sido terminados.
metadata.dc.description.goalsAchieved: 1er. año. Durante el primer año: 1. Se organizarán por lo menos 6 seminarios interinstitucionales en dependencias de la UNAM, impartidos por especialistas nacionales y extranjeros (3 por semestre). 2. Se organizará al menos 1 curso de una semana de duración sobre temas de vanguardia en Biología Matemática y Computacional, impartido por un especialista invitado del extranjero. Posibles candidatos para el 1er. Año: Prof. Thomas Hillen (Univ. de Alberta, Canadá), Prof. Zhilan Feng (Univ. de Purdue, EEUU), Prof. Elio Espejo (Univ. Nacional de Colombia). 3. Apoyo a, por lo menos, 2 cursos a nivel posgrado temáticos en Biología Matemática y Computacional 4. El Dr. Jorge Velasco publicará un libro (corto) sobre Biología Matemática en Elsevier, bajo el auspicio del proyecto. 2o. año: 1. Se organizarán por lo menos 6 seminarios interinstitucionales en dependencias de la UNAM, impartidos por especialistas nacionales y extranjeros (3 por semestre) 2. Se organizará al menos 1 curso de una semana de duración sobre temas de vanguardia en Biología Matemática y Computacional, impartido por un especialista invitado del extranjero 3. Apoyo a, por lo menos, 2 cursos a nivel posgrado temáticos en Biología Matemática y Computacional 4. Elaboración de la colección de diapositivas y videos del seminario interinstitucional, así como de los mini-cursos impartidos 5. Los Dres. Jorge Velasco y Ramón Plaza publicarán un texto a nivel de posgrado en Biología Matemática. Se dará crédito al proyecto.
metadata.dcterms.provenance: Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas (IIMAS)
metadata.dc.subject.DGAPA: Matemáticas
metadata.dc.type: Proyecto PAPIME
metadata.dc.contributor.coresponsible: VELASCO HERNANDEZ, JORGE XICOTENCATL
Aparece en las colecciones: 1. Área de las Ciencias Físico Matemáticas y de las Ingenierías

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